В состав Отдела входят два Центра:
В 2022-2024 гг. на базе отдела велась работа по гранту РНФ № 22-18-00365 "Семиотические модели в кросскультурном пространстве: Balcano-Balto-Slavica"
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Арина Витальевна Головачева (1937–2015);
доктор филологических наук, член-корреспондент Гёттингенской академии наук, академик РАН, член Парижского и Американского лингвистических обществ, главный научный сотрудник Андрей Анатольевич Зализняк (1935–2017);
доктор филологических наук, академик РАН, профессор UCLA, Иностранный член Американского лингвистического общества, Британской академии, создатель и директор Института мировой культуры МГУ, директор Русской антропологической школы РГГУ, главный научный сотрудник Вячеслав Всеволодович Иванов (1929–2017), руководивший Отделом с 1961 по 1989 год;
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Маргарита Ивановна Лекомцева (1935–2018);
доктор филологических наук, ведущий научный сотрудник Татьяна Николаевна Молошная (1932–2010);
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Лидия Георгиевна Невская (1938–2008);
доктор филологических наук, член-корреспондент РАН, член-корреспондент Гёттингенской академии наук, профессор, главный научный сотрудник Института Татьяна Михайловна Николаева (1933–2015), возглавлявшая Отдел с 1990 до 2012 года;
доктор филологических наук, старший научный сотрудник Исаак Иосифович Ревзин (1923–1974);
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Татьяна Николаевна Свешникова (1937–2008);
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Сергей Сергеевич Скорвид (1958–2025);
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Тамара Михайловна Судник (1939–2021);
доктор филологических наук, академик РАН, Член Academia Europaea, International Semiotic Society, International Language Origin Society, член International Philosophic Peirce Society, почётный член Академии наук Латвии, доктор honoris causa Вильнюсского университета, главный научный сотрудник Владимир Николаевич Топоров (1928–2005);
доктор филологических наук, профессор РГГУ, профессор Гамбургского университета, ведущий научный сотрудник Евгений Арнольдович Хелимский (1950–2007).
доктор филологических наук, ведущий научный сотрудник Петр Михайлович Аркадьев;
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Кирилл Александрович Кожанов;
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Анна Феликсовна Литвина;
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Максим Максимович Макарцев;
доктор наук, ведущий научный сотрудник Татьяна Владимировна Михайлова (Цивьян);
кандидат филологических наук, старший научный сотрудник Савва Михайлович Михеев;
доктор филологических наук, член-корреспондент РАН, заместитель директора Института славяноведения (2010 — 2019), руководитель Центра славяно-германских исследований (2006–2019) Федор Борисович Успенский, заведовавший Отделом с 2012 по 2019 г.
• Типология и сравнительное языкознание: славянские, балканские и балтийские языки, памятники письменности, контактология, индоевропеистика.
• Междисциплинарные исследования в области германо-славянских, балто-славянских и балкано-славянских языковых и культурных контактов в синхронии и диахронии.
• Анализ балканских, балтийских и славянских фольклорных текстов, с учетом выявленных общих закономерностей и архетипических мифологем.
• Этнолингвистические и семиотические исследования языка традиционной культуры балканских, балтийских и славянских народов.
• Работа над сводом древних надписей на стенах новгородского Софийского собора и других эпиграфических памятников.
• Многоаспектное изучение типологических параллелей в памятниках средневековой литературы Древней Руси и Западной и Центральной Европы, в том числе в магических текстах.
• Ономастика и семиотика.
В 2005 г. в Отделе создан Центр славяно-германских исследований (руководители – д. ф. н. Ф. Б. Успенский, с 2021 г. – к.и.н. С. М. Михеев). В его задачи входит историко-филологическое исследование древнерусско-скандинавских связей, изучение лингвистических контактов и взаимных влияний славянских и германских языков. Деятельность Центра временно приостановлена.
С 2007 г. в отделе функционирует Центр лингвокультурных исследований Balcanica (руководитель – д. ф. н. И. А. Седакова). В рамках этого Центра продолжается особая ветвь контактно-славянских исследований по балканистике, в основном представленная трудами Т. В. Цивьян, И. А. Седаковой и покойной Т. Н. Свешниковой. Ведется многоплановая работа по изучению балканских языков и культур, с особым вниманием к семиотическим аспектам. Проводятся ежегодные конференции и выпускаются два серийных издания по балканистике.
В 2008 г. в отделе создан Центр балто-славянских исследований (руководители – д. ф. н. Т. В. Цивьян, с 2021 г. – М. В. Завьялова), в задачи которого входит продолжение проводившихся в течение всего времени существования Отдела исследований славяно-балтийских языковых и культурных отношений, как диахронических, так и синхронно-типологических, отражаемых, в частности, в регулярной серии «Балто-славянские исследования».
21 мая 2013 г. Отделом была организована секция «Актуальные проблемы славянского языкознания» в рамках международной научной конференции «Славянский мир: общность и многообразие», посвященной 1150-летию славянской письменности (20–21 мая 2013 г.).